《学园默示录 第二季》故事来自于Chuck Logan的一本小说讲述了Phil Broker(杰森·斯坦森 饰)这位前药品管理局的人举家迁移到一个宁静的小镇希望能从过去的生活中逃脱然而他发现这个小逃脱然而他发现这个小镇被暴力、毒贩和一位叫Gator(詹姆斯·弗兰科 饰)的邪恶权贵所统治而他为了家庭必须与Gator进行抗争黑帮龙头大哥洪老大与家人于餐厅共晋晚餐向大家宣布退休后把所有生意交给幼子威饭后众人于餐厅外遇到袭击追随洪老大多年的仇震雄把老大推倒地上避过流弹却暗中把老大头部大力撞向楼梯令他伤重死亡雄拉拢老大长子华欲助他铲除威登上龙头大哥之位威母却早着先机派出杀手对付雄一家雄长子及长女遭毒手雄召次子志孝回港孝带同一帮朋友自荷兰回港不但替雄杀尽敌人更活捉了华让威亲手除掉亲弟孝完成任务准备与友人离开香港却发现雄为了灭口秘密把他们杀掉孝非常愤怒往杀掉威并把尸体藏在桌下雄见状大怒陷进疯狂状态把孝枪伤最后更精神崩溃孝则伤重不治主要讲述了伍四六原来有一个救过他命的双胞胎哥哥伍四五这让伍四六非常开心并帮助伍四五在清河县开了一家生产农肥的工厂京城出现地沟油皇上派人来秘查伍四五迷倒伍四六冒名顶替成功的骗过皇上派来的钦差的故事芈月的三段恋情也颇为引人注目芈月的初恋春申君黄歇却因种种客观原因不能善终而芈月和义渠君也有着深厚的情谊他是芈月成为太后路上最不可或缺的力量...